Llegó al Cádiz CF en el mercado invernal de la 2010-2011 y muy pronto consiguió ganarse a la afición, que le dedicó pancartas en la grada y grupo de animación incluído. 

Después de jugar en el San Fernando CD y un breve paso por el Xerez CD de Tercera División, rescindió para firmar por el Atlético Sanluqueño CF. Pero allí tampoco llegó a cuajar y se marchó a Gibraltar en busca de suerte deportiva en el College Europa y posteriormente en el Lincoln Red Imps FC, también de la colonia británica. Ahora el jiennense jugará en Tercera División y lo hará en las filas del CD Martos.

Juan Sebastián Pegalajar Valero nació en Jaén el 19 de abril de 1989. Se inició en el Torredonjimeno CF y posteriormente jugó en el Real Jaén Juvenil, Baeza CF, Glenn Hoddle Academy, UD Somozas, Jerez Industrial CF, Cádiz CF, San Fernando CD, Xerez CD, Atlético Sanluqueño CF, College Europa FC (Gibraltar), Lincoln Red Imps FC (Gibraltar) y CD Martos.